Fener Rum Lisesi, hem mimari hem de eğitim açısından İstanbul’un en görkemli binalarından biridir. Ayrıca, Osmanlı İmparatorluğu’nun son dönemlerinde ve cumhuriyetin ilk yıllarında pek çok önemli kişiyi yetiştirmiş bir kurumdur.
Fener Rum Lisesi, Fener’de, Patrikhane’nin yanında bulunmaktadır. Okulun tarihi 1454 yılına kadar uzanmaktadır. O zamanlar Fatih Sultan Mehmet ile Patrik Gennadios arasında yapılan bir anlaşma ile Fener sınırları içinde bir okul kurulmuştur. Bu okul, Patrikhane Akademisi ya da Rum Mekteb-i Kebiri olarak bilinmekteydi. Osmanlı Devleti, bu okula geniş olanaklar sağlamış ve okulun müdürleri din görevlileri arasından seçilmiştir.
Okulun mezunları arasında Osmanlı İmparatorluğu’nun en yüksek mevkilerinde görev almış pek çok Fenerli Rum vardır. Baştercümanlar, Eflak ve Boğdan beyleri, patrikler ve yüksek din görevlileri, bu okuldan yetişmiştir. Okul, cumhuriyetten sonra Fener Rum Erkek Lisesi adını almıştır.
Okulun bugünkü binası ise 19. yüzyılın sonlarında inşa edilmiştir. Okulun mimarı, Fener Rum Erkek Lisesi mezunlarından biri olan Dimadis’tir. Dimadis, Avrupa’nın çeşitli ülkelerinde şatolar yapmış bir mimardır. Okulun yapım malzemelerinin çoğu Marsilya’dan getirilmiştir. Okul, kırmızı tuğlalardan yapıldığı için halk arasında “Kırmızı Okul” olarak da anılmaktadır.
Okulun en dikkat çekici özelliği ise ortasındaki kubbeli kalın bir kulesidir. Bu kule, Haliç’in her iki yakasından da görülebilmektedir. Okulun geniş ve yüksek cephesi de mimari açıdan çok etkileyicidir. Okulun içinde ise pek çok sanat eseri ve tarihi belge bulunmaktadır.
Fener Rum Lisesi, günümüzde de faaliyet gösteren çok az sayıda kalmış Rum eğitim kurumlarından biridir. Okulda hem ilköğretim hem de lise eğitimi verilmektedir. Okulun öğrencileri hem Türkçe hem de Yunanca öğrenmektedirler. Okul, hem Türkiye hem de Yunanistan tarafından tanınan bir diplomaya sahiptir.